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Von Konstanz verläuft die Strecke über Radolfzell nach Singen. Hier beginnt die eigentliche Schwarzwaldbahn der Badischen Staatseisenbahn. Nach dem Verlassen des Rheintals erfolgt hinter Engen die Durchfahrt des Hattinger Tunnel. Nun folgt die Strecke der Donau bis zu ihrem Ursprung in Donaueschingen. Von dort führt sie nach Villingen und steigt dann beständig an, um bei Sommerau mit 832 m.ü.M. ihren höchsten Punkt zu erreichen. Hier beginnt die eigentliche Gebirgsstrecke, die in ihrer einmaligen Streckenführung Vorbild für viele andere Gebirgsbahnen wurde. Auf 26 km Strecke werden 448m Höhenunterschied überwunden und dabei 37 Tunnel passiert. Der Längste ist mit 1698m der Sommertunnel. Hinter diesem folgt die erste der beiden Kehrschleifen der Schwarzbahnen. Entlang des Gutachtales geht es bis Hausach, wo die Gutach in die Kinzig mündet und die Schwarzbahn durch das Tal der Kinzig schließlich in der Oberrheinebene Offenburg erreicht.